凈化車間的合理布局既要有利于各生產加工環節的相互之間聯接，又要有利于加工過程的清潔衛生控制，避免生產過程交叉式空氣污染的造成。

食品產業整個過程絕大多數全是以原料—→生產加工—→產品產量的整個過程，即從非清除到清除的整個過程，因此，生產制造生產線的生產加工一切正常狀況下，理應按照產品的生產制造、生產過程順序進行合理布局，使商品經濟生產加工從不清除的環節向清除環節對接，不允許在生產制造流程抽出現交叉式和倒流。

清潔區和非清潔區正中間要采取措施的隔離措施，有利于控制相互間的人流手術和物流貨運，從而避免導致交叉式空氣污染，加工品傳輸依據不銹鋼板不銹鋼傳遞窗進行。要在生產線內適當的地域，設置安全工器具清除，消毒間，配置供安全工器具清除，殺菌消毒用的清除槽，殺菌消毒槽和侵泡槽，必不可少時，有暖氣管交貨，沸水的溫度應不少于82℃。